建设工程合同纠纷损失可以这样计算：当事人因对方不履行建设工程合同义务而造成损失的，可以要求对方赔偿其损失，其中损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，这里的损失也包括合同履行后可以获得的利益，但是，不得超过违约一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违约可能造成的损失。因此，建设工程合同纠纷损失是按照实际发生损失来计算的，不可预见的损失是不需要赔偿的。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第五百八十四条 当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定，造成对方损失的，损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益；但是，不得超过违约一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违约可能造成的损失。
